Falla en la detección de SARS-CoV-2 mediante qRT-PCR en pacientes hospitalizados con COVID-19

Autores/as

DOI:

https://doi.org/10.47464/MetroCiencia/vol29/2/2021/23-31

Palabras clave:

qRT-PCR, Anticuerpos, SARS-CoV-2, COVID-19, ELISA

Resumen

Para muchos individuos sintomáticos, un solo resultado negativo de qRT-PCR (una de las varias pruebas NAAT) es suficiente para excluir el diagnóstico de COVID-19, sin embargo, si la prueba inicial es negativa pero la sospecha de COVID-19 sigue siendo alta y la confirmación de la presencia de infección es importante para el manejo o control de la infección, es imprescindible repetir la prueba. Un resultado negativo no excluye la posibilidad de una infección por SARS-CoV-2 y no debe utilizarse como el único criterio para tratamiento o decisiones de manejo del paciente. La combinación de qRT-PCR junto con una tomografía y las características clínicas-epidemiológicas facilitan el manejo de los pacientes con SARS-CoV-2. Este artículo tiene como objetivo analizar pacientes atendidos por COVID-19 en un hospital del sur de Quito, al inicio de la pandemia, que presentaron una prueba de qRT-PCR negativa. A los pacientes se les realizó detección de anticuerpos, estos fueron positivos debido a que las muestras de sangre fueron tomadas después de 2 semanas del inicio de los síntomas.

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Biografía del autor/a

Camilo Zurita-Salinas, Zurita & Zurita Laboratorio - Universidad Central del Ecuador

Unidad de Investigaciones en Biomedicina. Zurita & Zurita Laboratorios; Cátedra de Inmunología. Universidad Central del Ecuador. Quito, Ecuador

Francisco Xavier Mora, Hospital IESS Quito Sur

Hospital IESS Quito Sur. Quito, Ecuador

Hugo Ricardo Espejo, Hospital IESS Quito Sur

Hospital IESS Quito Sur. Quito, Ecuador

Marco Antonio Bonifaz, Hospital IESS Quito Sur

Hospital IESS Quito Sur. Quito, Ecuador

Citas

Wu F, Zhao S, Yu B, Chen YM, Wang W, Song ZG, Hu Y, Tao ZW, Tian JH, Pei YY, Yuan ML, Zhang YL, Dai FH, Liu Y, Wang QM, Zheng JJ, Xu L, Holmes EC, Zhang YZ. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature. 2020 Mar;579(7798):265-269. doi: 10.1038/s41586-020-2008-3. Epub 2020 Feb 3. Erratum in: Nature. 2020 Apr;580(7803):E7. PMID: 32015508; PMCID: PMC7094943

Wang C., Horby P.W., Hayden F.G., Gao G.F. A novel coronavirus outbreak of global health concern. Lancet. 2020;395:470–473. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30185-9.

Wu F, Zhao S, Yu B, et al. Complete genome characterisation of a novel coronavirus associated with severe human respiratory disease in Wuhan, China. bioRxiv 2020

Ai T, Yang Z, Hou H, Zhan C, Chen C, Lv W, Tao Q, Sun Z, Xia L. 2020. Correlation of Chest CT and RT-PCR Testing in Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) in China: A Report of 1014 Cases. Radiology 200642.

Xie X, Zhong Z, Zhao W, Zheng C, Wang F, Liu J. Chest CT for Typical Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Pneumonia: Relationship to Negative RT-PCR Testing. Radiology. 2020;296(2):E41-E45. doi:10.1148/radiol.2020200343

Corman Victor M, Landt Olfert, Kaiser Marco, Molenkamp Richard, Me er Adam, Chu Daniel KW, Bleicker Tobias, Brünink Sebastian, Schneider Julia, Schmidt Marie Luisa, Mulders Daphne GJC, Haagmans Bart L, van der Veer Bas, van den Brink Sharon, W sman Lisa, Goderski Gabriel, Romette Jean-Louis, Ellis Joanna, Zambon Maria, Peiris Malik, Goossens Herman, Reusken Chantal, Koopmans Marion PG, Drosten Christian. Detection of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) by real-time RT-PCR. Euro Surveill. 2020;25(3):pii=2000045. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045

Corman V, Bleicker T, Brünink S, Drosten C. Charité Protocol and preliminary evaluation as of Jan 13, 2020- Virology, Berlin, Germany Diagnostic detection of Wuhan coronavirus 2019 by real-time RT- PCR. https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/wuhan-virus-assay-v1991527e5122341d99287a1b17c111902.pdf Acceso abril 2020

World Health Organization. Laboratory testing for coronavirus disease (COVID-19) in suspected human cases: interim guidance. WHO/COVID-19/laboratory/2020.5. Geneva: WHO; 2020. Disponible en: https://www.who.int/publications-detail/laboratory-testing-for-2019-novel-coronavirus-in-suspected-human-cases-20200117

Shen, M., Zhou, Y., Ye, J., Abdullah Al-Maskri, A. A., Kang, Y., Zeng, S., & Cai, S. Recent advances and perspectives of nucleic acid detection for coronavirus. Journal of pharmaceutical analysis, 2020; 10(2), 97–101. https://doi.org/10.1016/j.jpha.2020.02.010

Noh JY, Yoon SW, Kim DJ, et al. Simultaneous detection of severe acute respiratory syndrome, Middle East respiratory syndrome, and related bat coronaviruses by real-time reverse transcription PCR [published correction appears in Arch Virol. 2017 Dec 22;:]. Arch Virol. 2017;162(6):1617-1623. doi:10.1007/s00705-017-3281-9

Infectious Diseases Society of America. COVID-19 Prioritization of Diagnostic Testing. https ://www.idsociety.org/globalassets/idsa/public-health/covid-19-prioritization-of-dx-testing.pdf (Accessed on May 29, 2020)

Wang Y, Kang H, Liu X, et al. Combination of RT-qPCR testing and clinical features for diagnosis of COVID-19 facilitates management of SARS-CoV-2 outbreak. J Med Virol. 2020 Feb 25. [Epub ahead of print]. DOI:10.1002/jmv.25721

Lieberman JA, Pepper G, Naccache SN, Huang ML, Jerome KR, Greninger AL. Comparison of Commercially Available and Laboratory-Developed Assays for In Vitro Detection of SARS-CoV-2 in Clinical Laboratories. J Clin Microbiol. 2020;58(8):e00821-20. Published 2020 Jul 23. doi:10.1128/JCM.00821-20

Oliveira BA, Oliveira LC, Sabino EC, Okay TS. SARS-CoV-2 and the COVID-19 disease: a mini review on diagnostic methods. Rev Inst Med Trop Sao Paulo. 2020;62:e44. Published 2020 Jun 29. doi:10.1590/S1678-9946202062044

Liu Y, Yan LM, Wan L, et al. Viral dynamics in mild and severe cases of COVID-19. Lancet Infect Dis. 2020;20(6):656-657. doi:10.1016/S1473-3099(20)30232-2

Xie X, Zhong Z, Zhao W, Zheng C, Wang F, Liu J. Chest CT for typical 2019-nCoV pneumonia: relationship to negative RT-PCR testing. Radiology. 2020 Feb 12; [doi: 10.1148/radiol.2020200343].

Li D, Wang D, Dong J, et al. False-Negative Results of Real-Time Reverse-Transcriptase Polymerase Chain Reaction for Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2: Role of Deep-Learning-Based CT Diagnosis and Insights from Two Cases. Korean J Radiol. 2020;21(4):505-508. doi:10.3348/kjr.2020.0146

Chung M, Bernheim A, Mei X, et al. CT Imaging Features of 2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV). Radiology. 2020;295(1):202-207. doi:10.1148/radiol.2020200230

Wang Y, Kang H, Liu X, Tong Z. Combination of RT-qPCR testing and clinical features for diagnosis of COVID-19 facilitates management of SARS-CoV-2 outbreak. J Med Virol. 2020;92(6):538-539. doi:10.1002/jmv.25721

Green DA, Zucker J, Westblade LF, et al. Clinical Performance of SARS-CoV-2 Molecular Tests. J Clin Microbiol. 2020;58(8):e00995-20. Published 2020 Jul 23. doi:10.1128/JCM.00995-20

Wang W, Xu Y, Gao R, et al. Detection of SARS-CoV-2 in Different Types of Clinical Specimens. JAMA. 2020;323(18):1843-1844. doi:10.1001/jama.2020.3786

Yu F, Yan L, Wang N, et al. Quantitative Detection and Viral Load Analysis of SARS-CoV-2 in Infected Patients. Clin Infect Dis 2020; 71:793.

Kucirka LM, Lauer SA, Laeyendecker O, Boon D, Lessler J. Variation in False-Negative Rate of Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction-Based SARS-CoV-2 Tests by Time Since Exposure. Ann Intern Med. 2020;173(4):262-267. doi:10.7326/M20-1495

Guo L, Ren L, Yang S, et al. Profiling Early Humoral Response to Diagnose Novel Coronavirus Disease (COVID-19). Clin Infect Dis. 2020;71(15):778-785. doi:10.1093/cid/ciaa310

Furukawa NW, Brooks JT, Sobel J. Evidence Supporting Transmission of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 While Presymptomatic or Asymptomatic. Emerg Infect Dis. 2020;26(7):e201595. doi:10.3201/eid2607.201595

Zhao R, Li M, Song H, et al. Early detection of SARS-CoV-2 antibodies in COVID-19 patients as a serologic marker of infection. Clin Infect Dis 2020; doi: 10.1093/cid/ciaa523

Zhang G, Nie S, Zhang Z, Zhang Z. Longitudinal Change of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Antibodies in Patients with Coronavirus Disease 2019. J Infect Dis 2020;222(2):183-188. doi:10.1093/infdis/jiaa229

Yang, Wenjing et al. “The role of imaging in 2019 novel coronavirus pneumonia (COVID-19).” European radiology 2020;30(9):4874-4882. doi:10.1007/s00330-020-06827-4

Araujo-Filho, J. D. A. B., Sawamura, M. V. Y., Costa, A. N., Cerri, G. G., & Nomura, C. H. COVID-19 pneumonia: what is the role of

Publicado

2021-04-30

Cómo citar

Zurita-Salinas, C., Xavier Mora, F., Espejo, H. R., & Bonifaz, M. A. (2021). Falla en la detección de SARS-CoV-2 mediante qRT-PCR en pacientes hospitalizados con COVID-19. Metro Ciencia, 29(2), 23–31. https://doi.org/10.47464/MetroCiencia/vol29/2/2021/23-31

Número

Sección

Artículos Originales

Artículos más leídos del mismo autor/a